| T00063 | ype | Yersinia pestis CO92 (biovar Orientalis) |
| T00092 | ypk | Yersinia pestis KIM10+ (biovar Mediaevalis) |
| T01874 | yph | Yersinia pestis Harbin 35 (biovar Medievalis) |
| T00369 | ypa | Yersinia pestis Antiqua (biovar Antiqua) |
| T00370 | ypn | Yersinia pestis Nepal516 (biovar Antiqua) |
| T00165 | ypm | Yersinia pestis 91001 (biovar Microtus) |
| T00505 | ypp | Yersinia pestis Pestoides F (biovar Antiqua) |
| T00635 | ypg | Yersinia pestis Angola |
| T01210 | ypz | Yersinia pestis Z176003 |
| T01831 | ypt | Yersinia pestis A1122 |
| T01832 | ypd | Yersinia pestis D106004 |
| T01833 | ypx | Yersinia pestis D182038 |
| T03716 | ypw | Yersinia pestis PBM19 |
| T03717 | ypj | Yersinia pestis Harbin35 |
| T03718 | ypv | Yersinia pestis Shasta |
| T03719 | ypl | Yersinia pestis El Dorado |
Species: Yersinia pestis